У меня аналогичные проблемы.Прокси рабочие 100%.Это происходит в тот момент когда работают одновременно 2 или более скомпилированых или запланированых проекта, и один из них либо завершает работу,либо начинает.
И еще вопросик-почему после отработанных скриптов не завершаются процессы в диспетчере задач,может тому и есть виной эта проблема?