Так и сделал))
Некоторые файли удалось восстановить с помощью программ для восстановления
Использовал Recuva (бесплатная), Hetman partition recovery(платная) может кому-то пригодится.
Ничего из этого не помогает, зато выяснилось что помогает запускать скрипт, ставить на паузу в определенных местах и просто двигать мышью вручную, причем в режиме непрямого управления, в котором, по идее, движения мыши не должны передаваться.
Естественно, пробовал скриптом рандомизировать движение мыши в этих местах, но безуспешно.
