появляется табличка, запустить или нет. решается запуском баса от имени администратора или расположением файла в системной директории. можно ли это делать как то иначе?
Как вариант использовать другие селекторы, не CSS. Вот мануал.
Судя по ошибке, вы пытаетесь вызвать функцию как переменную, смотрите в скрипте.
Функция OnApplicationStart вызывается !один! раз при запуске скрипта. Для вызова функций в любых других местах скрипта создайте свои функции.