Скорее всего, потому-что в запуске быстрее отрабатывает и элементы не успевают появиться какие-то. Надо добавить пауз или ожидания элемента перед теми кнопками, которые не нажимаются.
@денис Есть же экшен во вкладке браузер "Выполнить яваскрипт". Так же можно на странице браузера выбрать выполнить яваскрипт на элементе, селектор можно отключить.
