@Elger CSV стандарт предполагает что кавычки " хранятся/записываются в файл как "".
тут необработанность и парсера(или нет? лень думать) и того что записывал в файл неформат.
то что " убрались все при парсинге наглядно видно.
Лучше базу использовать на таком объеме.
И имейте ввиду, что удаление строки в ресурсе, приведет к удалению всех дублей.
А ты через встроенный менеджер базы данных в меню база вверху пробовал через импорт из csv файла ? только разметить файл надо.
Кроме того, можно поставить клиент для mongodb и подключится к базе, тогда можно через командную строку загрузить дайнные из файла.
https://metanit.com/nosql/mongodb/2.3.php
внизу статьи загрузка из файла.