Вообщем проблема решилась сама собой, после включения/выключения компа, память сама очистилась за ночь) Я до этого всегда на вдс-ках запускал скрипты и не замечал что бас столько места занимает
подключаетесь по SQL к сторонней базе через NodeJS наверное, и так же записываете данные обратно. Вызывать скрипт можно через время с помощью планировщика задач, или как нибудь ещё придумать...
