@Foppy скорее всего в файле-задании строки просто размножены и не отличаются друг от друга никак. Поэтому баз при ошибке вытирает все копии строки.
Правится это добавлением в строку уникального идентификатора( порядковый номер строки или рандомный набор символов, который не будет использоваться в работе и будет стоять, например, последним в строке и не попадать под уже существующий парсинг csv строки).
В этом случае при краше будет удалятся только строка, которая была в работе.