Решил проблему прописав полный путь к скрипту в верхнем окне.
Непонятно одно, это действительно так было задумано, чтобы не возможно было прописать путь рабочей папки с переменными?
Например мне надо подписаться в ok.ru много раз с одного аккаунта, как это сделать, так чтобы не надо было перезаходить в аккаунт каждый раз в каждом потоке.
Для каждого потока создавайте свой профиль, который при последующих вхождениях будет использован.