Наверное, FastSpace имеет ввиду загрузку URL в той же вкладке, в которой было открыто расширение. Обычно это лечится открытием новой вкладки, но по словам топикстартера, проблема остается даже после перезапуска скрипта - это уже нетипично)
@forall еще перезапуск можно нажать, чтобы все удалилось. а вообще... удалить текущей элемент использую во всех скриптах. удобно, да и логику скрипта можно проделать до мелочей