Скорее всего, потому-что в запуске быстрее отрабатывает и элементы не успевают появиться какие-то. Надо добавить пауз или ожидания элемента перед теми кнопками, которые не нажимаются.
@DrPrime То что вы описали, с этим я согласен. Но у меня получается случай с метками такой что все они не выходили за пределы одной функции. И например в этой ситуации если возврат по скрипту делать с помощью рекурсии, то проблем не возникает.