В басе есть вариант как подцепить ресурс и вытянуть все файлы из папки, но как подцепить так, чтобы можно было чекнуть сколько папок в этой папке и из каждой папки доставать и использовать фалйы?
Скорее всего, потому-что в запуске быстрее отрабатывает и элементы не успевают появиться какие-то. Надо добавить пауз или ожидания элемента перед теми кнопками, которые не нажимаются.