If you want the second folder to stay updated with the potential changes that appear in the original folder after working with it, then yes, you would need to copy it again.
@bablotyt впн/прокси внутри расширений не поддерживаются. Не забывайте что вы используете кастомную сборку Chromium и там изменены многие детали движка и алгоритмы.
